BYAKUGAN

É a herança passada geneticamente pelo Clã Hyuuga, uma Kekkei Genkai. Com ele ativado, o membro ganha várias vantagens, relativas à visão. Primeiro de tudo, o Byakugan permite que o usuário veja o sistema circulatório de chakra das pessoas, sendo que membros com o Byakugan mais poderoso pode ver os Tenketsus. Eles também ganham uma visão de 360°, a maior e melhor habilidade desses ninjas, que permite que o ninja veja ao seu redor o que acontece ao mesmo tempo, com uma pequena falha, um ponto cego em cima das vértices. O ninja pode estender o seu campo de visão, se focalizando num único ponto e avançando vários metros, para ver o que acontece na sua frente. A última habilidade, e nem por isso menos importante, é uma visão que penetra nas coisas sólidas, podendo ver algo depois de algo Ela ainda permite que ele aumente seu campo de visão, visualizando algo longe, podendo ver através dos objetos. Os principais usuários de byakugan são Hyuuga Neji, Hyuuga Hizashi, Hyuuga Hiashi, Hyuuga Hanabi e Hyuuga Hinata.
Aliado a essa visão, os usuários do Byakugan desenvolveram um estilo de luta próprio, o Jyuuken Ryuu. Vendo o sistema de chakra da pessoa, o ninja emite chakra de suas mãos, machucando o interior da pessoa, junto com seus órgãos internos. Isso é mais mortal do que muitas técnicas, já que o interior do corpo não pode ser treinado. Ninjas mais poderosos podem ver os Tenketsus, os atacando, podendo diminuir ou aumentar o fluxo de chakra do oponente.
Para proteger os segredos do Byakugan, foram criadas várias regras dentro do Clã. Existe uma Família Principal e a Secundária. A missão da Secundária é cuidar da Principal, protegendo-a a todos os custos. Para garantir isso, é posto no membro da Secundária um Selo. Quando o membro da Principal achar necessário, pode utilizar esse selo até mesmo para matar um membro da familia secundária. selo também tem a função de selar o Byakugan de um membro da família secundária que possa vir a morrer, assim o Byakugan não poderá ser utilizado após a morte e nem detectado, caso o corpo seja analisado. O nome Byakugan significa, em japonês, "olhos brancos".

SHARIGAN

O Sharingan é uma habilidade exclusiva do clã Uchiha, uma Kekkei Genkai. Não se tem muita informações sobre sua origem, apesar de teorias dizerem que o Sharingan descende do Byakugan, do Clã Hyuuga, porém não é algo confirmado. Segundo Uchiha Itachi, o Sharingan tem uma história e uma razão para ter sido criada, e isso explicaria um dos rituais mais estranhos, a criação do Mangekyou Sharingan. Essa origem do Sharingan está explicada numa sala especial do clã, apesar de não ter sido revelada ainda. É utilizada por Hatake Kakashi (apesar de não ser membro do clã), Uchiha Itachi, Uchiha Fugaku, Uchiha Sasuke e Uchiha Obito.

O Sharingan é uma pupila vermelha com pequenas vírgulas negras nele. Quanto mais vírgulas melhor será o Sharingan, chegando no total de três. Funciona de um jeito muito especial: ele prevê os movimentos do adversário. Qualquer ação do oponente será registrada pelo Sharingan, e um ninja bem treinado pode esquivar de ataques. Ela também prevê jutsus, só que com uma habilidade especial: ela não só prevê como copia. O jutsu usado fica guardado na memória do oponente (que precisa treiná-la, depois de copiá-la), e ele a usa sempre que quiser. Quem usa também consegue acessar genjutsus próprios. Com apenas um olhar, o oponente pode perder os sentidos, sentir medo, ver algo que não é real.
Quem não conhece as habilidades do Sharingan pode cair num genjutsu ainda mais avançado: a pessoa começa a acreditar que o portador do Sharingan pode ler seus movimentos e pensamentos, se desesperando, começando a deixar os seus movimentos mais fáceis de serem lidos; prevendo isso, o portador do Sharingan completa frases e copia movimentos, atordoando o inimigo, até criar uma cópia do oponente na mente dele, mostrando para ele tudo o que ele deve fazer e dizer. O oponente se desespera e é mais fácil derrubá-lo.
Para despertar o Sharingan, o ninja deve estar correndo risco de morte, numa batalha muito difícil. Não aparece instaneamente, demora até que apareça. Ela começa pequena e fraca, mas com o desenvolver do usuário ela cresce consideravelmente.
Para se derrotar um usuário do Sharingan existem várias estratégias. A principal delas é se especializar em taijutsu, ganhando mais velocidade do que o ninja, podendo vencê-lo antes dele poder esquivar de seu ataque, porém nem sempre isso é possível. Outra técnica é não olhar nos olhos do ninja, se guiando pelos pés dele. O aconselhável é sempre pensar: se for um contra um, o ninja sem Sharingan deve fugir. Se for dois contra um, os ninjas precisam trabalhar em conjunto para que um deles atraia a

CLÃ UCHIHA

Não se sabe quando foi originado, mas teorias apontam que o clã descende diretamente do clã Hyuuga, depois que a Kekkei Genkai deles começaram a sofrer mutações. O clã cresceu consideravelmente, ficando respeitado e famoso. Vivia numa região especial dentro de Konoha, tendo seus próprios interesses e obrigações. Fundaram a Polícia, que no começo só tinha membros Uchihas. Numa noite só, um dos membros, Uchiha Itachi, assassinou todos os seus familiares. Somente o irmão mais novo de Itachi, Uchiha Sasuke, sobreviveu.
O Sharingan permite que esse ninja preveja os movimentos do adversário. Assim, o ninja pode lutar com maestria no taijutsu. Outra habilidade útil é a cópia de Jutsus, usados ao mesmo tempo que o do inimigo. Esse jutsu fica guardado, e pode ser usado a hora que o ninja quiser. E ele ainda pode usar um Genjutsu,e tambem pode destruir Genjutsu com o próprio do Sharingan. Com essas habilidades, todos os ninjas do clã são considerados gênios e temidos na batalha. Para lutar contra usuários do Sharingan, existem algumas estratégias, como evitar olhar nos olhos do ninja e sempre tentar atacar no ponto cego do usuário, as costas.

CLÃ KAGUYA

O Clã Kaguya era um clã muito poderoso no País da Água, por causa de sua Kekkei Genkai. Sempre que começava uma guerra era utilizados, o que fez seus membros ganharem um certo prazer nas lutas. Viraram um clã militar, com interesse apenas na guerra. Se deliciaram com as batalhas da Terceira Guerra Secreta. Quando ela acabou, os membros desse clã queriam mais, e pensaram em atacar Kirigakure no Sato. Juntaram todos e invadiram. Foram massacrados. Somente o jovem Kaguya Kimimaro sobreviveu.
Sua Kekkei Genkai, Shikotsu Myaku (Passagem dos Ossos do Corpo), permite que o ninja controle livremente os ossos de seu corpo. Ele pode retirar o osso de seu braço e utilizá-lo como arma ou um escudo, ou ainda os dois simultaneamente; atirar pedaços dos ossos para atacar o oponente. Tudo isso somado à rápida recuperação dos ossos faz com que o ninja ataque e se defenda ao mesmo tempo. Normalmente, a limitação desse controle varia de pessoa para pessoa, alguns nascendo com mais controle do que os outros. Mesmo assim, essa Kekkei Genkai traz limitações: pela complexidade do corpo do usuário, raramente um tratamento normal fará resultado. E ainda tem a possibilidade de uma doença rara aparecer nessa pessoa, o que significa a morte dela.
As técnicas próprias dessa Kekkei Genkai, logo, únicas desse clã, são: Karamatsu no Mai, Sawarabi no Mai, Teshi Sendan, Tessenka no Mai, Tsubaki no Mai, Yanagi no Mai.

CLÃ INUZUKA

É um clã do País do Fogo respeitado, com a peculiaridade de utilizar cachorros como companheiro nas lutas. O ninja recebe seu cão ainda pequeno. Os dois começam a criar uma existência amigável, até ao ponto do ninja entender o que o seu mascote tenta expressar por latidos e gestos. Os dois desenvolvem a confiança entre si.
A luta de um ninja desse clã é sempre fruto de uma aliança entre homem e cão. O cão, quase sempre grande, ataca com força bruta, com a ajuda da força e da estratégia do ninja. Para melhorar sua técnica, o ninja luta como se fosse um animal, aumentando o seu olfato com o acúmulo de chakra na região do nariz, lutando quase sempre de quatro, deixando os seus dentes afiados. Na hora da luta, os dois lutam de forma sincronizada. Para melhorar sua habilidade, é comum o uso de Pílulas do Soldado, que aumenta consideravelmente a força dos dois.
Os jutsus conhecidos usados pelo clã são: Bakuretsu Koinu, Juujin Bunshin, Konbi Henge no Jutsu, Shikyaku no Jutsu, Inuzuka Ryuu Chinjuu Konbi Henge: Soutou Rou, Garouga e Gatsuuga

CLÃ HYUUGA

O clã é dividido em duas partes: a família principal e a família secundária. Na família principal, apenas o primeiro filho(a) continua nela. O segundo, terceiro e os outros que possam vir farão parte da família secundária, cujo objetivo da família secundária é proteger a família principal. Para que eles não façam nada de errado, um selo é posto na cabeça deles quando pequenos. Qualquer ação que o membro da principal perceba, com apenas um selo de mão ele pode faz o membro da secundária ter uma forte dor de cabeça, podendo matá-lo. Outro uso do selo é selar todos os conhecimentos do Byakugan quando a pessoa morre, para evitar que saia da família. Hyuuga Hiashi e suas duas filhas Hyuuga Hinata e Hyuuga Hanabi são da família principal, enquanto Hyuuga Neji e seu pai Hyuuga Hizashi são da secundária. Hiashi e Hizashi são irmãos gêmeos, mas Hiashi foi para a principal por nascer primeiro. Mesmo assim, o gênio do clã nasceu na família secundária, o que deixa Hiashi numa posição difícil.
O Byakugan permite que o usuário tenha uma visão 360° (com uma pequena área invisível), que pode ver através das coisas, se estendendo por vários metros. Com a utilização dessa Kekkei Genkai, esse clã criou uma técnica especial, um Taijutsu, considerado por muitos o mais forte de Konoha: Jyuuken Ryu. Com esse estilo, o ninja pode atacar o sistema de chakra do oponente, visível graças ao Byakugan. Algumas técnicas possíveis com o uso desse estilo é: Hakke Kuushou, Hakke Rokujuuyonshou, Hakke Hyakunijuuhachishou e Hakkeshou Kaiten.

CLÃ ABURAME

É um clã muito famoso dentro e fora do País do Fogo, onde residem. São úteis pela sua habilidade de controlar insetos de variados tipos. Apesar de clãs parecidos existirem em outros Países, o Clã Aburame é o maior e o mais famoso. Para ganhar a ajuda dos pequenos seres vivos, são postos no corpo quando ainda é pequeno. Eles se alimentam do chakra do ninja, e em troca são usados na batalha pela manipulação do chakra. Os membros conhecidos são Aburame Shino e Aburame Shibi.
Controlando o seu chakra, o ninja pode usá-lo para um ataque ou defesa, ou ainda para outras finalidades. Os insetos são controlados livremente de várias formas: para picar o inimigo, envenenando (ou paralisando) o oponente; no rastreamento de alguma coisa ou alguém; numa defesa, usando os inúmeros insetos como barreia; e de várias outras maneiras diferentes, como retirar o veneno do corpo.
Os jutsus próprios desse clã conhecidos são: Kikaichuu no Jutsu, Mushi Bunshin no Jutsu, Mushi Kame no Jutsu e Mushi Yose no Jutsu.

BIJUU

Existem demônios (bijuus) (esse nome é apenas algo dado a eles, eles não têm nenhuma ligação com o diabo ou algo parecido) que possuem grandes poderes e muito chakra. Eles são bestas com caudas. Cada um tem um número diferente de caudas, variando de uma a nove, sendo que cada um recebe o nome de acordo com o número de caudas: Ichibi tem uma cauda (ichi = 1), Kyuubi tem nove (kyuu = 9), e assim em diante, para os outro sete demônios.
Os únicos conhecidos são o Ichibi, conhecido por outro nome, Shukaku, um tanuki (guaxinim), a Kyuubi uma kitsune (raposa),Nibi um nekomata (gato) de uma garota do pais do Raio,e a Sanbi uma Isonade um animal marinho. Como esses quatro estão de acordo com uma lenda japonesa que fala de nove demônios, especula-se que os outros seguem a mesma linha, sendo o Hachimata, Nekomata, e outros.
Quem recebe o bijuu no seu corpo recebe o nome de Jinchuuriki (人柱力, poder do sacrifício humano), e ganha poderes extraordinários. Muitas guerras foram iniciadas para ganhar o controle dessas bestas, úteis no campo de batalha. Normalmente esses monstros quando estão soltos gostam de destruir, sendo muito difícil de derrotar um, pela força que tem, o chakra enorme e pelo tamanho. Cada vilarejo tenta controlar um.
Os Jinchuurikis, por causa desse poder, muitas vezes são temidos, não têm amigos, se tornam distantes, perdem o controle de seu corpo (já que o bijuu é preso à força no corpo), o que aumenta o ódio de todos por eles. É assim que Uzumaki Naruto e Gaara era tratado por todos, como um demônio que matou gente. Deidara confirma isso, dizendo que quando a Akatsuki pegou dois jinchuurikis os vilarejos em que eles estavam não se mobilizaram para recuperá-los.
Os Jinchuurikis conhecidos são: Uzumaki Naruto que tem a Kyuubi; Gaara que tem o Ichibi Shukaku; Yugito, do Vilarejo do Trovão, que tem a Nibi. Recentemente se descobriu que o Shodaime Hokage tinha um controle sobre essas bestas, apesar de não sabermos até onde ia, e que o colar que ele usava ajudava nesse controle. A organização Akatsuki está capturando jinchuurikis e tirando os bijuus dele, matando-os no processo, para algum propósito desconhecido.
Todos os bijuus são esses (com exceção do Ichibi e da Kyuubi, todos os outros são mera especulação):
Ichibi
Um texugo, usado por Gaara, de nome Shukaku. Vem da lenda da Tanuki. Esse Bijuu dá para seu usuário o controle da areia e utiliza jutsus do elemento vento;
Nibi
Um gato de dois rabos, o Nekomata, usado por Yugito, uma ninja do Vilarejo da Nuvem. Dá para seu usuário a possibilidade de se transformar na sua forma verdadeira, um gato, enorme e forte, que atira rajadas de fogo pela boca e dando ao usuario a sabedoria infinita. (Ele foi capturado pela organização da Akatsuki mas Yugito conseguiu recupera-la olhando em seus olhos)
Sanbi
Um animal marinho de três rabos, Isonade;
Yonbi
Possivelmente uma espécie de ave com cobra, o Soukou;
Gobi
Possivelmente um cão de cinco caudas, o Houkou;
Rokubi
Ppossivelmente um Raijuu, da mitologia japonesa, um esquilo;
Shichibi
Possivelmente um Kaku um texugo;
Hachibi
Possivelmente um Hachimata, uma serpente ou um dragão, de poder somente comparável ao da Kyuubi.
Kyuubi
Uma raposa de nove caudas, a mais forte, vem da lenda da Kitsune, usado pelo Uzumaki Naruto. Dá para seu usuário o seu chakra enorme, recuperação rápida (quase instantânea), e outros poderes. Os únicos métodos conhecidos de se selar os bijuus em alguém são: Prisão de Bijuu (versão Chiyo) e Shiki Fuujin.

Ele pensa somente em ter uma vida simples, sem muitos problemas. Ele é muito preguiçoso, odeia escrever, e por isso sempre foi mal nas provas do seu professor da Academia, Umino Iruka. Depois de virar genin (ninja iniciante), seu novo mestre, Sarutobi Asuma, tentou ver o quão inteligente Shikamaru era, e fez um jogo disfarçado de Teste de QI, e descobriu que Shikamaru tinha um quociente de inteligência de mais de 200. Shikamaru nunca teve uma convivência feliz com as mulheres, já que acha que elas são problemáticas. Com seu trio de genins (Yamanaka Ino e Akimichi Chouji) ele é o estrategista, formando a técnica Ino-Shika-Cho.

Chouji, desde pequeno, foi discriminado pelas crianças por ser gordo. Normalmente, os ninjas na sua família são gordos, então ele achava que seria um ninja inútil. Nara Shikamaru foi o primeiro a se aproximar dele, e ele escutou de seu pai que os verdadeiros amigos são poucos, logo ele deveria ficar sempre ao lado deles. Depois de virar Genin, caiu no time da Yamanaka Ino e de Nara Shikamaru.
Ficou apenas tentando fugir das lutas, mas ao ver a determinação de seus companheiros decidiu ficar forte. No Chuunin Shiken, enfrentou Dosu nas preliminares, mas é vencido facilmente. Treinou sozinho, escondido de todos, principalmente de seu sensei, Sarutobi Asuma. Tanto esforço foi recompensado, já que ele ficou muito forte.Quando Uchiha Sasuke saiu do vilarejo, Nara Shikamaru rapidamente montou um time com eles dois, Hyuuga Neji, Uzumaki Naruto e Inuzuka Kiba. Chouji ficou para trás para lutar contra Jiroubou, um dos quatro do Som, guardiões do Sasuke. Lutou contra ele arriscando sua própria vida, derrotando-o.
Depois de tanto tempo consegue o posto de chuunin. Vê Naruto de volta ao vilarejo, depois de dois anos e meio, mas são atacados por Sai, que quer testar o poder de Naruto. Chouji queria ir na missão com seu amigo, mas Ino o lembra de uma missão.
Logo, seu sensei, Sarutobi Asuma, foi morto por um membro da Akatsuki, Hidan. Chouji parte com Ino, Shikamaru e Kakashi atrás de Hidan e seu companheiro Kakuzu. Ele auxilia Shikamaru na luta, mas fica pasmo com a habilidade de Kakuzu de ter 5 corações. Logo, o time de Uzumaki Naruto salva Chouji e os outros, e Chouji presencia o terrível ataque de Naruto, o Fuuton Rasenshuriken

É uma ninja jovem e bonita, companheira de Akimichi Chouji e Nara Shikamaru, treinados por Sarutobi Asuma. Trabalha na floricultura de sua família, aprendendo rapidamente sobre as flores, conseguindo fazer arranjos florais com facilidade. Sempre disputou o amor de Uchiha Sasuke, junto com outras tantas garotas principalmente, Sakura.
Depois de dois anos e meio sem ver Naruto, ela é mandada junto com o time 7(liderado por Kakashi) para a base da Akatsuki onde é salva por Naruto com seu Fuuton: Rasenchuriken. Ino fica impressionada com a evolução de Naruto.
Ela é de um clã muito famoso igual o Uchiha e o Hyuuga, chamado "Clã Yamanaka".

Virou o Jounin do time 10, algo que sempre o deixou preocupado. Ino sempre se preocupava com sua beleza, Chouji só comia, e Shikamaru não queria saber de problemas. Mesmo assim, achava Shikamaru muito inteligente, e fez com ele um teste de QI, descobrindo que Shikamaru tinha mais de 200. No Chuunin Shiken, não esperava que seu time chegasse até a segunda fase, se espantando com Shikamaru, que subiu até a terceira fase, e se graduou como chuunin.
Quando Konoha foi atacada por Orochimaru, Asuma derrotou muitos invasores. Salvou Shikamaru do ataque de 9 ninjas, sem muitos problemas. Quando a situação se acalmou, ficou fazendo muitas missões, acumuladas com a falta de ninjas. No intervalo entre eles, percebeu a presença de duas pessoas suspeitas. Yuuhi Kurenai e ele seguiram os dois, e encontraram Hoshigaki Kisame e Uchiha Itachi. Tentaram lutar contra os dois, mas foram derrotados. Hatake Kakashi salva os dois, mas é derrubado por Itachi. Maito Gai chega, e os dois ninjas decidem fugir.
Mais tarde, percebe algo de estranho, e decide conversar com Kakashi, de cama, após uma missão. Quando vai falar, Yuuhi Kurenai chega, e Asuma prefere adiar, saindo com ela. Vai para o túmulo de seu pai, avisar que finalmente o compreende. Chama Shikamaru para jogar shogi. Usando as peças como metáfora, Asuma se considera como uma peça descartável, que protege alguém mais importante. Shikamaru pergunta se essa peça é o Hokage, mas Asuma diz que não é, e que uma hora Shikamaru entenderá quem é. De repente, Uzumaki Naruto chega, e pede conselhos para Asuma de como controlar o elemento do vento. Pedindo um almoço no restaurante Yakiniku, Asuma o ensina a utilidade do elemento.
Tsunade invoca Shikamaru, Asuma, e outros 78 ninjas, divididos em grupo de 4 pessoas. A missão deles é parar os membros da Akatsuki de andarem no País do Fogo, matando-os, se necessário. Asuma sabe que um dos Doze Guerreiros foi morto, Chiriku. Asuma, Shikamaru, e outros dois ninjas se preparam para seguir em frente. Descobrem que Chiriku pode ter sido morto por causa da recompensa na sua cabeça, e decidem ir atrás de quem oferece dinheiro por ela. Ao chegar no local dos Akatsukis, armam uma enboscada atingindo Hidan um dos membros, porem ele se mostra invulneravel a qualquer golpe. Kakuzu Aparece pra ajudar mais Hidan Recusa sua ajuda e amaldiçoa Asuma com um jutsu que tranfere suas proprias dores pro oponente. Shikamaru Consegue desfazer o Jutsu e Asuma corta a cabeça de Hidan mais ele continua invulneralvel. Kakuzu como Ninja medico concerta o pescoço de Hidan que dá um golpe final acabando com Asuma. Shikamaru sente o coração de Asuma ainda batendo concluindo que ele continuava vivo e os Akatsukis vão embora devido a um chamado do Lider. Mesmo assim poucos minutos depois Asuma pede seu ultimo cigarro e morre deixando todos da vila muito abalados

Yuuhi Kurenai cuidou de seu time até o Chuunin Shiken, onde ficou apenas vigiando. Quando Orochimaru atacou Konoha ajudou a atacar os invasores. Depois que a situação se acalmou, participou de muitas missões, para preencher o vazio dos ninjas mortos. Um dia, saiu para fazer compras com Sarutobi Asuma, e encontrou no meio do caminho dois ninjas misteriosos. Os seguiu, e descobriu que eles eram Uchiha Itachi e Hoshigaki Kisame, dois membros da Akatsuki. Lutaram contra eles, mas foram derrotados. Hatake Kakashi os salvou, mas caiu na técnica do Itachi. Maito Gai chega, e os dois Akatsukis resolvem fugir.
Mais tarde, fica sabendo que Kakashi está de cama depois de voltar de uma missão. Vai até o quarto dele apenas para chamar Sarutobi Asuma, e encontra os dois conversando. Aparentemente, Asuma iria contar algo, mas com a chegada de Kurenai ele preferiu deixar para depois, seguindo-a.
No mangá é mostrado que depois da morte de Sarutobi Asuma ela estaria gravida, e que teria um romance com o mesmo.

Sua irmã, Hyuuga Hanabi, apesar de não ser a herdeira, tem um grande potencial, o orgulho de Hyuuga Hiashi, pai das duas. Seu tio já morto, Hyuuga Hizashi, irmão gêmeo de Hiashi, teve um filho que é o gênio do clã, Hyuuga Neji, que nutria um ódio pelo clã por causa de falta de informação de uma história entre seu pai e seu tio e pela sua condição de guardião. Por causa disso ele fere Hinata gravemente no Chuunin Shiken, mas ela se recupera.
Mesmo depois de mais de dois anos sem ver Naruto ela ainda sente algo por ele, se encabulando logo no primeiro encontro. Na fase atual do mangá, Hinata está participando de uma missão cujo objetivo é ir atrás tanto de Sasuke quanto de seu irmão Itachi, e assim tentar impedir uma quase inevitável luta entre os dois, para então trazer Sasuke de volta para Konoha. Juntamente com Naruto, Yamato e um dos cães ninja de Kakashi, Hinata acaba se deparando com Kabuto, agora fundido aos restos mortais de Orochimaru. Fazendo-se uso do Byakugan, ela consegue enxergar o interior do corpo de Kabuto, e afirma que 30% de seu corpo já está tomado pela presença de seu grande mestre.

Quando pequeno, recebeu seu cão Akamaru de sua mãe, Inuzuka Tsume, como era costume no seu clã, e os dois cresceram com uma relação de confiança fortíssima. Virou genin e entrou no time 8. Participou do Chuunin Shiken, passando facilmente pela primeira fase com a ajuda de seu cão. Na segunda fase, passou com facilidade, já que seu time está acostumado com sobrevivência na floresta. Nas preliminares da terceira fase, lutou contra Uzumaki Naruto, perdendo para ele. Viu a terceira fase da arquibancada, onde encontrou com Yakushi Kabuto, disfarçado, que derrubou Hinata e Kiba.
Logo depois, Nara Shikamaru e Uzumaki Naruto foram avisá-lo de que Uchiha Sasuke tinha ido atrás de Orochimaru. Após a chegada de Akimichi Chouji e Hyuuga Neji, os cinco partiram para trazê-lo de volta. Encontraram no caminho Jiroubou, mas Chouji ficou para derrotá-lo. Encontram Kidoumaru, mas Neji o segura. Os três que sobraram têm uma idéia de como tirar Sasuke das mãos dos ninjas que o protegem. Eles enganam seus inimigos, e pegam Sasuke, mas uma armadilha mal posta por Akamaru derruba Kiba, seu cão, e Sakon num precipício. Lá embaixo, Kiba luta ferozmente contra seu oponente, mas descobre que existe um segundo oponente, Ukon, que por causa da Kekkei Genkai deles, Souma no Kou, pode se esconder dentro do corpo de Sakon. Kiba e Akamaru, gravemente feridos, fogem, mas são encontrados. Kankurou chega e os salva, matando os dois irmãos.

No Chuunin Shiken, recebe a missão de ajudar Gaara no ataque à Konoha. Na terceira fase do exame, iria enfrentar Aburame Shino, mas desiste, já que Sasuke não tinha chego. Na luta de Gaara e Uchiha Sasuke, Gaara perde o controle de seu bijuu, e por isso fica impossibilitado de fugir. Temari e Kankurou fogem com ele, seguidos de perto por Sasuke. Kankurou tenta pará-lo, mas Shino chega, e luta contra ele. Shino facilmente o derrota, mas é envenenado, e quase morre. Temari e Kankurou resgatam Gaara, que havia perdido para Uzumaki Naruto, e o levam embora, espantados que Gaara resolveu mudar de atitude: se preocupando com as pessoas e o amor.
Recebe uma missão com seus dois irmão, a de ajudar no resgate a Uchiha Sasuke. Kankurou salva Inuzuka Kiba na luta dele contra Sakon e Ukon, matando os dois irmãos gêmeos. Temari, Kankurou e Gaara voltam para Suna.
Fica feliz ao ver seu irmão virar Kazekage, e decide proteger os ideais novos de Gaara. Fica espantado ao ver Gaara lutar contra um membro da Akatsuki, e perder, sendo levado embora. Segue o invasor, e se depara com outro membro da Akatsuki, Sasori. O ninja inimigo facilmente lê os ataques de Kankurou, e o envenena. Kankurou está fadado a morrer, mas Haruno Sakura, enviada de Konoha, chega e o salva do veneno. Pede para Uzumaki Naruto, que chegou junto com ela, para ele salvar o Gaara. Quando se recupera, parte com Temari atrás do time de Hatake Kakashi, que havia ido atrás de Gaara, junto com vários ninjas. Chega na hora em que ele acorda, presenciando Chiyo trocar a sua vida pela a do Kazekage. Voltam para casa, feliz por Gaara estar vivo.

Temari recebeu a missão, junto com seus irmãos, de destruir Konoha. O plano era utilizar a habilidade do Shukaku, dentro de Gaara, na terceira fase do Chuunin Shiken. Os três passaram facilmente para a última fase, principalmente Temari, que venceu Ten Ten sem receber nenhum machucado. Na terceira fase, Temari encontrou Nara Shikamaru. Pensou que fosse ganhar dele facilmente, mas Shikamaru usou sua estratégia de modo exemplar, prendendo Temari no seu Kage Mane no Jutsu, porém o chakra dele acabou, e ele desistiu da luta, dizendo que não tinha como ele vencer. Na luta de Gaara, ele usou o Shukaku antes da hora, e teve que recuar, escoltado por Temari e Kankurou. Uchiha Sasuke os perseguiu. Kankurou ficou para trás, mas Sasuke rapidamente seguiu Temari. Gaara acordou e lutou contra Sasuke, liberando a sua forma quase perfeita. Temari se escondeu, e observou Uzumaki Naruto chegar e lutar contra Gaara na forma perfeita, assustada. Viu espantada Gaara perder, e rapidamente o pegou, fugindo com ele. Observou que essa luta mudou a opinião de Gaara, vendo que ele se importa com as pessoas.
Recebeu uma missão com seus irmãos de ajudar no resgate de Uchiha Sasuke. Ajudou Nara Shikamaru a derrotar Tayuya, com apenas um golpe. Ficou amiga de Shikamaru depois desse incidente.
Gaara virou um Kazekage, e Temari, com Kankurou, jurou proteger os ideias do novo líder de seu vilarejo. Virou examinadora do Chuunin Shiken, passando informações de Suna para Konoha, e vice versa. Um dia, sentiu algo, e voltou para seu vilarejo. Encontrou Hatake Kakashi, Haruno Sakura e Uzumaki Naruto no caminho. Fica sabendo por eles que Gaara foi sequestrado pela Akatsuki, e os leva até seu vilarejo. Quer ajudar o time de Kakashi a resgatar seu irmão, mas uma das conselheiras de Suna, Chiyo, diz que ela vai, que Temari não é necessária. Assim que seu irmão, Kankurou, se recuperou da luta contra um dos sequestradores de Gaara, Sasori, Temari partiu com ele e mais alguns ninjas atrás do Kazekage. Encontrou Chiyo morrendo e Gaara acordando, são e salvo. Voltou para casa feliz, com seus irmãos.

Participou do Chuunin Shiken, mas não conseguiu passar da eliminatória da terceira fase do Chuunin Shiken, perdendo da Temari sem machucá-la. Treinou bastante, até virar uma ninja poderosa.
Dois anos depois, seu time foi chamado para ajudar o time Kakashi na missão de resgate do Kazekage Gaara das mãos da Akatsuki. Encontraram Hoshigaki Kisame no caminho, mas ele foi derrotado por Maito Gai, que descobriu que era apenas um falso. Ao chegarem no esconderijo, seu time se separou, para quebrar a barreira. Ao desativar uma das cinco partes do selo protetor, uma cópia sua foi criada. Lutou contra ela, a vencendo com dificuldade. Depois, ajudou a encurralar Deidara, que fugia de Uzumaki Naruto e Hatake Kakashi.

O pai de Neji, Hyuuga Hizashi, e o tio de Neji, Hyuuga Hiashi, são irmãos gêmeos, só que Hiashi nasceu primeiro, logo foi para a família principal do clã Hyuuga e o pai de Neji para a secundária. Neji cresceu aprendendo a dificuldade do clã secundário. Um dia aparece um ninja com uma mensagem do Raikage do vilarejo escondido do Trovão querendo selar a paz entre Konoha e seu país. Na verdade, esse ninja tinha uma outra missão: sequestrar Hyuuga Hinata (que por coincidência completava seus quatro anos) para descobrir o segredo do Byakugan. Ele foi descoberto e morto. O Raikage ameaçou o Hokage, Sarutobi, de que iria iniciar uma guerra por causa desse ocorrido, porém ele ficaria quieto se recebesse algo: o corpo do líder do clã Hyuuga, Hyuuga Hiashi. O Hokage conversou com os líderes do clã Hyuuga, que concordaram. Só que sem Hiashi saber, seu irmão gêmeo, Hyuuga Hizashi, pai de Neji, aceitou ficar no lugar dele. Hiashi implorou que Hizashi não fizesse isso, mas Hizashi disse "eu não faço isso por você e sim apenas por poder escolher meu destino". Como Hizashi era da família secundária ele tinha um selo que lacrava o Byakugan assim que ele morresse. Como os dois irmãos eram iguais, o corpo foi mandado. Tudo acabou bem entre os dois vilarejos.
Neji escutou mal a história e entendeu que seu pai foi obrigado a morrer para salvar seu tio. Desde então ele nutriu um ódio pela família principal. Ele se confortou num pensamento: o destino de todos é selado. Um vencedor é sempre um vencedor, um perdedor é sempre um perdedor, um membro da família secundária morre como membro da família secundária. Só que Neji era um gênio. Sozinho ele aprendeu as maiores artes do Byakugan, desenvolvendo uma defesa perfeita com seu Kaiten e um ataque perfeito com seu Jyuuken Ryuu (estilo). Esse ódio que ele tinha no coração acaba quando Uzumaki Naruto o ensina a ter bondade, a mudar o futuro. Mostrando seus talentos no Chuunin Shiken, Hiashi se desculpa, conta toda a história para Neji e promete treiná-lo com o Byakugan. Mais tarde, Neji participa da missão de trazer Uchiha Sasuke de volta a Konoha junto com Akimichi Chouji, Nara Shikamaru, Inuzuka Kiba e Uzumaki Naruto. Neji enfrenta Kidoumaru e tem uma luta muito sofrida e seu inimigo acaba descobrindo um ponto cego no Byakugan. Neji acaba sendo perfurado duas vezes pelas flechas de Kidoumaru no selo amaldiçoado nível 2. Mesmo quase morto, ele transfire o último golpe em Kidoumaru e fica inconsciente. Sua vida é salva por Shizune e um grupo de ninjas médicos de Konoha e se recupera. Neji vira um ninja mais forte, supera o ódio e se torna um jounnin em Konoha.
É mandado para a missão de resgate do Gaara nas mãos da Akatsuki. Na hora de liberar um selo da entrada, se separou de seu grupo e acabou lutando contra uma réplica sua. Depois de muito esforço e estratégia ganhou. Ajudou seu time a encontrar Deidara. Depois todos voltaram para Konoha.

Quando jovem, Rock Lee ficou sabendo que nunca ia poder usar jutsus. Por isso, ele decidiu se focar apenas no taijutsu (combate corpo-a-corpo). Ele foi o primeiro ninja a passar com apenas taijutsu. Para sua sorte caiu no time de Maito Gai, conhecido como um dos maiores ninjas no taijutsu. Para seu azar caiu no time do gênio Hyuuga Neji. Logo no primeiro dia ele conheceu a rivalidade de Maito Gai e Hatake Kakashi. Conheceu um dos princípios básicos do treinamento de Gai: se você quer algo, diga que se não conseguir vai fazer algo absurdamente impossível, como dar 500 voltas no vilarejo. Desse jeito você se vê obrigado a ganhar, e se não ganhar você fará um treinamento para ganhar na próxima vez. É desse jeito que ele, Gai, diz ter superado seu eterno rival, Kakashi. Lee acha um rival, no mesmo time que ele, Neji. O taijutsu, o Jyuuken Ryuu, de Neji é considerado o melhor. Com o Hakkeshou Kaiten Lee nem consegue chegar perto dele. Por isso, Lee decide que vai derrotar Neji e provar para ele que um fracassado pode vencer um gênio com trabalho duro.
Tanto trabalho duro o deixou forte, ágil, conseguindo a proeza de abrir cinco portões de chakra. Participou do Chuunin Shiken, com o objetivo de mostrar que é forte. Desafiou Uchiha Sasuke para uma batalha, para testá-lo. Uzumaki Naruto entrou no caminho, e foi facilmente derrotado. Sasuke, quando seria derrotado, foi salvo por Maito Gai, que parou Lee. Na segunda fase do torneio, passou sem problemas. Nas eliminatórias da terceira, enfrentou Gaara. De início perdeu, mas Gai liberou que Lee tirasse os pesos da perna, ganhando mais agilidade. Usou dois kinjutsus, mas isso não foi suficiente. Rock Lee abriu cinco dos oito portões de chakra e começou a pauliar Gaara. Mas seu corpo não aguentou, e Gaara, nervoso, destruiu a perna e o braço de Lee. Hospitalizado, recebeu a notícia de que nunca mais poderia ser ninja. Gai prometeu que deixaria de ser ninja se Lee também deixasse. Se espantou com o crescimento de Uzumaki Naruto.
A nova Hokage, Tsunade, chegou ao vilarejo de Konoha. Ela disse que Lee tinha esperanças, se fizesse uma cirurgia complicada e arriscada, Maito Gai disse que se a operação fosse um fracasso, ele iria morrer junto com Lee. A cirurgia foi um sucesso. Lee ficou muito feliz, e decidiu ficar cada vez mais forte. Quando nem estava recuperado da cirurgia, ficou sabendo que Uchiha Sasuke estava fugindo do vilarejo, para ir atrás do Orochimaru. Uzumaki Naruto, Hyuuga Neji, Inuzuka Kiba, Akimichi Chouji e Nara Shikamaru partiram. Rock Lee decidiu ajudá-los, e partiu. Encontrou Naruto lutando contra Kaguya Kimimaro. Disse para Naruto ir atrás de Sasuke, que Kimimaro era dele. A luta entre os dois estava difícil, já que a Kekkei Genkai de Kimimaro era poderosa. Rock Lee acabou ingerindo saquê, por engano, e conseguiu dificultar as coisas para Kimimaro. Quando voltou ao normal, iria perder, se Gaara não tivesse chego, e impedido o ataque. Gaara lutou contra Kimimaro. Numa última investida, Kimimaro tentou matar os dois, mas uma doença misteriosa o abateu, e ele morreu.
Rock Lee treinou, e virou chuunin. Recebeu uma missão, junto com Maito Gai, Hyuuga Neji e Ten Ten de ir até Suna salvar Gaara das mãos da Akatsuki. Eles iriam ajudar o time Kakashi. No meio do caminho encontraram Kisame Hoshigaki que queria uma revanche contra Maito Gai. Rock lee tentou lutar contra ele,mas ele,Neji e Tenten foram presos por prisões de água. Maito Gai venceu Kisame Hoshigaki,mas descobriram que aquele não era o verdadeiro. Chegaram no lugar, e se separaram para quebrar o selo que protegia o lugar. Rock Lee lutou contra uma cópia sua, uma proteção do selo. Quando venceu, seguiu atrás de Hatake Kakashi e Uzumaki Naruto, cercando um bushin de Deidara, que sem escolha se explodiu. Junto com seus companheiros voltou para casa.Agora Está em busca de dois Akatsukis Pein e Tobi junto a sua equipe

Sua rivalidade com Kakashi é grande,Kakashi ganhando 50 vezes, contra 49 dele próprio. Esse seu jeito foi copiado pelo Lee.
Quando Uchiha Itachi e Hoshigaki Kisame aparecem em Konoha, ele os segue, porém não chega a tempo de salvar Kakashi do ataque do Itachi. Os dois membros da Akatsuki fogem. Ainda preocupado, vai atrás de Jiraya e Uzumaki Naruto, porém na hora de salvá-los chuta por engano o rosto de Jiraya. Ele leva de volta o inconsciente Uchiha Sasuke, que caiu após lutar contra Itachi.
Depois de dois anos e meio, recebeu uma missão de ser o time de ajuda ao time Kakashi na missão de resgate ao Kazekage de Suna, Gaara. Ele e seu time encontram Kisame, querendo revanche contra Gai, só que Gai nem lembra quem o seu inimigo é. Depois de uma luta feroz, Gai o derrota, e descobre que aquele Kisame era um falso, feito por um jutsu, o Shouten no Jutsu. Chega no portão do esconderijo da Akatsuki, onde aparece Kakashi, Uzumaki Naruto, Haruno Sakura e Chiyo. Por causa do selo, o time de Gai se separa, para poder quebrá-lo.
O selo é quebrado, porém cada membro do grupo de Gai tem que lutar contra uma cópia sua. As cópias são derrotadas, e o time Gai ajuda a encurralar Deidara, que quase fugiu de Kakashi e Naruto. Ele, porém, se explode. Gai e seu time voltam para Konoha.

Gaara é da equipe de Temari e Kankurou, e ex-integrante do time Baki, treinado pelo ninja Baki. Nascido em Sunagakure, Gaara perdeu sua mãe no parto ao ter sido selado com Shukaku (uma besta do deserto), criando uma relação simbiótica com esta Ichibi. Seu pai é o quarto Kazekage. Foi criado por seu tio, Yashamaru, quando pequeno. Quando o Kazekage resolveu assassiná-lo (já que estava se assustando com o poder dele) Gaara percebeu que seu pai o criara apenas para conseguir o alto nível de chakra presente em seu corpo. O Kazekage mandou Yashamaru, seu tio,matá-lo. Seu tio o atacou pelas costas, mas Gaara sem saber quem era, acabou atacando e matando-o. Quando liberou todo o ódio acumulado em sua mente, Gaara funde seu chakra com Shukaku, permitindo-o controlar a areia e o tornando muito poderoso. A partir de então, Gaara decide matar todos, para se sentir vivo, já que essa é a única razão dele ter vivido.
Ajudou Suna no ataque a Konoha. Sua missão era despertar o seu bijuu na terceira fase do Chuunin Shiken. Sua missão quase falhou ao encontrar Rock Lee nas eliminatórias da terceira fase, ao lutar contra ele. A luta inicialmente foi apenas de Gaara, mas Rock Lee rapidamente ganhou a vantagem. Infelizmente, o uso de dois kinjutsus, Ura Renge e Omote Renge, fez com que Rock Lee ficasse seriamente ferido, e Gaara destruiu um braço e uma perna de seu oponente, passando para a terceira fase do exame, numa luta contra Uchiha Sasuke, algo que Gaara esperava.
Gaara tentou entender os seus sentimentos, e foi terminar de matar Rock Lee, só que foi impedido por Maito Gai, e desistiu. Na terceira fase, estava esperando ansiosamente a luta contra Sasuke. Ela foi atrasada, já que Sasuke demorou. Quando chegou, Gaara e Sasuke finalmente lutaram. Usando seu Chidori, Sasuke quebrou a defesa de Gaara, que se escolha começou a liberar o Shukaku. Parou no meio da transformação, o que o deixou incosciente. O ataque à Konoha se iniciou, só que Gaara teve que ser recuado, por causa de seu estado. Sasuke o seguiu. Quando Gaara conseguiu andar, lutou contra Sasuke, usando a sua forma monstruosa. Uzumaki Naruto e Haruno Sakura chegaram, quando Sasuke estava sem condições de lutar. Sakura foi presa pela técnica de Gaara, e Naruto prometeu salvá-la. Os dois lutaram com todas as forças, e Gaara viu que Naruto nunca iria ganhar, já que lutava pelos outros. Ele liberou a forma perfeita do Shukaku, virando um monstro gigante. Naruto envoca Gamabunta e luta contra shukaku. Gaara se vê derrotado.Os dois ficam sem força pois gastaram muito chakra. Seus irmãos Temari e Kankurou chegaram, e levaram Gaara embora.
Gaara, com a força de vontade de Naruto, resolveu mudar seu modo de pensar. Gaara entendeu o que é amor e a verdadeira força, ajudar os próximos. Decide proteger as pessoas, sendo cada vez mais próximo ao seu amigo, Naruto. Uma de suas primeiras missões é ajudar Konoha numa missão de resgate. Gaara encontra Rock Lee lutando contra Kaguya Kimimaro, quase morrendo. Rapidamente o salva, e manda Rock Lee voltar, que a luta é dele, agora. Luta com todas as suas forças, mas Kimimaro é forte demais. Usa um ataque desesperado, que é inefetivo.Gaara e Rock Lee ficam conversando quando Kimimaro sai da terra e quando ele se prepara para mata-los a sua doença o ataca, o matando.
Gaara decide proteger as pessoas, ficando mais forte, e vira um Kazekage. O que ele não sabe é que ganhou esse título apenas para que os conselheiros de Suna ficassem de olho nele. É sequestrado pela Akatsuki, depois de uma luta com Deidara,que ganha. Eles retiram seu bijuu, matando-o no processo. Uma das conselheiras de Suna, Chiyo, usa uma Técnica de Ressureição que o revive, mas ela morre no processo. Quando Gaara acorda ele vê Naruto, seus irmãos, Temari e Kankurou, junto com vários ninjas da Suna. É quando ele percebe o quanto é querido. Volta para seu vilarejo, onde continua o seu trabalho.

No Chuunin Shiken, Shino lutou contra Zaku, vencendo sem problemas. Na terceira fase, seu oponente era Kankurou, que desistiu. Shino ficou esperando a sua próxima luta, quando escutou Kankurou falando sobre um ataque. Quando ninjas inimigos invadiram Konoha, Shino seguiu Uchiha Sasuke, que seguia Kankurou. Encontrou os dois lutando, e pediu para Sasuke ir atrás de Gaara, que Kankurou era dele. Os dois lutam, com a vitória de Shino. Quando Uchiha Sasuke decide ir para Orochimaru, Shino só não é chamado para a missão por ter ido fazer uma missão com seu pai, Aburame Shibi. Aparece mais tarde, rapidamente, dois anos e meio depois, quando já é chuunin.

É desbocada, adora falar o que passa na cabeça, soltando alguns palavrões. Mesmo assim ela é uma das mais fortes dos Quatro do Som. Sua arma principal é uma flauta. Quando ela usa seu Selo amaldiçoado Selo Amaldiçoado nível 1 ela consegue invocar três espíritos que ela controla com música. Se eles falharem ela ativa seu Selo Amaldiçoado nível 2 e solta genjutsus no seu oponente. A única arma que ela tem é sua flauta.mas ainda sim os irmãos sakon e ukon são mais fortes que a tayuya como diz seu mestre orochimaru. Quando membro dos 4 do Som, apareceu um quinto membro, Kimimaro, que sozinho derrotou os quatro, e virou líder deles. Só que ele ficou doente, e os 4 do Som voltaram a ser quatro. Eles, mais tarde, ajudaram seu mestre Orochimaru no ataque à Konoha. E o ajudaram uma última vez, levando Uchiha Sasuke para Orochimaru. Só que no meio do caminho eles tiveram que enfrentar dois jounins e mais tarde alguns genins de Konoha. Tayuya lutou contra um deles, Nara Shikamaru, e quase o matou, depois dele ter feito uma estratégia perfeita e ter ficado sem chakra, mas outra ninja, dessa vez de Suna, Temari, o salvou e a matou.

Geralmente, fica dentro de seu irmão Sakon (graças à sua kekkei Genkai), dormindo, a não ser quando necessário, que é quando ele pode atacar de qualquer parte de seu irmão, dando um chute a partir da barriga de Sakon, por exemplo. Ele pode usar seu Kisei Kikai para entrar no corpo de seu oponente e matá-lo de dentro. Se estiver dentro do corpo de seu irmão, pode se regenerar rapidamente. Quando membro do Quarteto do Som, apareceu um quinto membro, Kaguya Kimimaro, que sozinho derrotou os quatro, e virou líder deles. Só que ele ficou doente, e teve que sair do grupo. Eles, mais tarde, ajudaram seu mestre Orochimaru no ataque à Konoha, o ajudando uma última vez, levando Uchiha Sasuke para Orochimaru. No meio do caminho eles tiveram que enfrentar dois jounins e mais tarde alguns genins de Konoha. Ukon e seu irmão Sakon lutaram contra Inuzuka Kiba e seu cão, Akamaru. Eles quase mataram os dois, mas outro ninja, de Suna, Kankurou, matou os dois irmãos gêmeos.

Geralmente, fica dentro de seu irmão Sakon (graças à sua kekkei Genkai), dormindo, a não ser quando necessário, que é quando ele pode atacar de qualquer parte de seu irmão, dando um chute a partir da barriga de Sakon, por exemplo. Ele pode usar seu Kisei Kikai para entrar no corpo de seu oponente e matá-lo de dentro. Se estiver dentro do corpo de seu irmão, pode se regenerar rapidamente. Quando membro do Quarteto do Som, apareceu um quinto membro, Kaguya Kimimaro, que sozinho derrotou os quatro, e virou líder deles. Só que ele ficou doente, e teve que sair do grupo. Eles, mais tarde, ajudaram seu mestre Orochimaru no ataque à Konoha, o ajudando uma última vez, levando Uchiha Sasuke para Orochimaru. No meio do caminho eles tiveram que enfrentar dois jounins e mais tarde alguns genins de Konoha. Ukon e seu irmão Sakon lutaram contra Inuzuka Kiba e seu cão, Akamaru. Eles quase mataram os dois, mas outro ninja, de Suna, Kankurou, matou os dois irmãos gêmeos.

Lembra muito uma aranha, tem seis braços e a habilidade de fazer teias. Curte brincar com seus inimigos antes de matá-los. Usa sua teia para proteger o Quarteto do Som, vendo quem está na sua volta quando alguém enconsta em sua teia. Suas teias podem ser usadas tanto para ataques como para defesas. Cria sua teia por meio de um líquido dourado que é criado fundindo o líquido do corpo com chakra. Também pode endurecer essa substância o quanto ele quiser, podendo criar armadura, flechas, armas, kunais, etc. Quando membro do Quarteto do Som, apareceu um quinto membro, Kimimaro, que sozinho derrotou os quatro, e virou líder deles. Só que ele ficou doente, e o Quarteto do Som voltou a ter quatro membros. Eles, mais tarde, ajudaram seu mestre Orochimaru no ataque à Konoha, o ajudarando uma última vez, levando Uchiha Sasuke para Orochimaru. No meio do caminho eles tiveram que enfrentar dois jounins e mais tarde alguns genins de Konoha. Kidoumaru luta contra Hyuuga Neji exatamente por ele poder cortar suas teias de chakra com seu Jyuuken. Perde para ele, mas quase o mata.

Kimimaro é do clã Kaguya, conhecido pela sua Kekkei Genkai de manipulação dos ossos tanto para ataque quanto para defesa. Na guerra o clã achava seu lugar, só que ela acabou. O clã não estava acostumado com paz, por isso decidiu ir atacar o Vilarejo da Névoa (Kiri), onde todos foram massacrados, menos o mais talentoso e o mais forte, o jovem Kimimaro. Depois da morte de toda sua família, ele ficou andando, sozinho. Foi quando conheceu Orochimaru, que o levou para seu esconderijo. Kimimaro percebeu que sua vida havia sido salva por esse homem, que seria fiel a ele, não importando o que acontecesse. A única pessoa que se importou com ele, que cuidou dele, merecia poder usar seu poder. Assim, Kimimaro ficou fiel ao Orochimaru, ganhando o Selo Amaldiçoado da Terra. Por causa de sua força, virou o quinto membro do Quarteto do Som, o líder deles. Ajudou Orochimaru em seus planos, como o assassinato do Kazekage. No ataque em Konoha uma doença misteriosa atingiu Kimimaro, que foi retirado e levado para estudos. Yakushi Kabuto tentou de tudo, mas sem os arquivos médicos do clã Kaguya Kimimaro iria morrer. Orochimaru queria usar o poder de Kimimaro, trocando de corpo com o dele graças ao Fushi Tensei, só que ele preferiu o Sharingan de Uchiha Sasuke. Kimimaro estava esperando a morte, vendo a sua inutilidade, quando decidiu ser útil para Orochimaru, ajudando a trazer seu novo corpo, Uchiha Sasuke, para o esconderijo de Orochimaru. Kimimaro fez Sasuke ganhar mais tempo, atrasando Uzumaki Naruto, mas Naruto vai atrás de Sasuke, e Rock Lee luta contra Kimimaro. Depois de quase morrer, Rock Lee é salvo por Gaara, que luta contra Kimimaro. Quando eles pensam terem vencido, Kimimaro aparece com um osso na sua mão apontado para Gaara, mas ele morre por causa de sua doença antes de matar os dois.

A história de Kabuto é muito confusa, sem informações precisas. As informações podem não ser verdadeiras, por isso ele é sem dúvida o personagem mais misterioso de Naruto. Yakushi Kabuto era pequeno quando foi achado no meio do campo de batalha. Seus pais, ninjas médicos, foram mortos, então ele cresceu como genin em Konoha. Mesmo sendo genin, desenvolveu jutsus medicinais, treinando tanto até ficar no nível de Hatake Kakashi, segundo Orochimaru. Não se sabe quando, mas Kabuto entrou para a organização conhecida como Akatsuki, virando um subordinado de Sasori, recebendo um jutsu para esquecer quem ele era, o Kenboushou Jutsu. Uns três anos antes do início da história, pouco depois de Orochimaru ter saído da Akatsuki, Kabuto recebeu a missão de espioná-lo. Kabuto gostou tanto do jeito de Orochimaru que resolveu ajudá-lo: Orochimaru retirou o jutsu de Sasori e mandou que Kabuto fingisse que tudo estava normal entre ele e a Akatsuki. Assim ele ajudou Orochimaru na sua pesquisa com corpos já que ele era um ninja médico, ganhando a confiança do sannin das cobras, virando seu braço direito. Kabuto participou em sete Chuunin Shiken, sendo que pelo menos no sétimo, antes do ataque de Orochimaru, ele estava juntando informações para Orochimaru. Mostrou ter algum poder escondido numa hora que ele tinha apanhado e seus olhos ficaram vermelhos, só que ele não deixou esse poder sair, se acalmando. Juntou as informações necessárias e ficou andando pelo vilarejo, servindo de mensageiro entre Suna e Orochimaru, que estavam juntos para destruir Konoha. Foi espionar Uchiha Sasuke quando ele estava no hospital. Matou os dois ANBUs que o protegiam. Hatake Kakashi entrou e o pegou, mas Kabuto o enganou e fugiu pela janela. Quando o ataque começou, a terceira fase, Kabuto usou um Nehan Shouja no Jutsu para fazer todos dormirem. Rapidamente se escondeu, e ajudou Orochimaru a fugir, quando sua invasão falhou. O braço de Orochimaru tinha sido selado pelo Sandaime Hokage. Kabuto tentou curar, mas não podia fazer nada. Orochimaru optou por chamar Tsunade. Ele prometeu para Tsunade que se ela o curasse, ele poderia reviver o irmão e o amado dela. Deu para ela uma semana para refletir. Quando ela apareceu, tentou matar Orochimaru, e Kabuto o salvou. Os dois lutam contra Tsunade. Shizune, Jiraya e Uzumaki Naruto aparecem. Naruto derruba Kabuto com um Rasengan. Orochimaru decide lutar contra Jiraya e Tsunade juntos, mas perde, e foge com Kabuto. Agora, Kabuto e Orochimaru vão esperar um novo corpo para Orochimaru, Uchiha Sasuke, que será trazido sob a escolta do Quarteto do Som. Kabuto toma conta de Kaguya Kimimaro, quase morrendo por causa de uma doença, infelizmente sem cura. Ao perceber a demora de Sasuke, Kimimaro se oferece para ser útil uma última vez, trazendo Sasuke. Kabuto concorda. Mesmo assim, a chegada de Sasuke demora, e Orochimaru não aguenta. Kabuto vai até todos os presos de Orochimaru e diz que terá uma luta entre todos eles, e o último de pé será o novo corpo de Orochimaru. Gen'yumaru é o escolhido. Sasuke chega, mas o corpo dele só será usado em 3 anos. Quando Sasori pediu que Kabuto o encontrasse, Orochimaru decide fazer um teatrinho: Kabuto fingiria estar sob o comando de Sasori, e os dois o prenderiam. Assim fizeram. Quando Kabuto foi atacar Sasori, descobriram outro ninja, Yamato disfarçado de Sasori. Orochimaru aparece, seguido por Haruno Sakura, Sai e Uzumaki Naruto. Kabuto se espanta, e Orochimaru se mostra indiferente, e cita Uchiha Sasuke, enfurecendo Naruto, que libera o chakra da Kyuubi. Kabuto voa longe e desacorda. Quando acorda, se cura. Vê a forma monstruosa de Naruto. Sakura tenta parar Naruto, mas é empurrada pela cauda de Naruto, que agora é uma besta assassina. Kabuto a cura, dizendo que se eles sobreviverem, a chance de um Akatsuki cair é maior. Diz que Orochimaru deve estar pronto e vai embora. Ele encontra Sai e o imobiliza, desconfiado. Orochimaru lê uma carta de Sai, escrita por Danzou, e pede que Kabuto pare com o que está fazendo, que o Sai vai com eles. Na viagem, Kabuto avisa Orochimaru que estão sendo seguidos. Orochimaru já sabia, deixando um corpo, disfarçado de Sai, enforcado para trás. Kabuto continua nervoso, já que perdeu um de seus valiosos corpos nessa brincadeira, e pede outro para repor. Ao voltar pro esconderijo, um ninja com seu Sharingan os espera: Uchiha Sasuke, nervoso com a demora. Sasuke intimida Sai. Orochimaru pede para Kabuto atualizar alguns arquivos. Kabuto recebe a mensagem de Danzou, e vê uma lista de todos os ANBUs de Konoha. Ele prende Sai numa sala e vai fazer o que Orochimaru pediu. Ele se lembra que esqueceu os papéis na sala de Sai. Ao voltar, vê que Uzumaki Naruto e seus companheiros conseguiram encontrar Sai. Ele encontra Sai amarrado e o liberta, porém Sai o trai, e Kabuto termina preso. Ele explica onde Sasuke está, no fundo do esconderijo, dizendo que nunca irão encontrá-lo, e vê a equipe de Yamato partir. Orochimaru o liberta, e os dois vão atrás de Sasuke. O impedem de matar o seu antigo time, e fogem com ele, dizendo que o time de Naruto precisa matar mais um membro da Akatsuki.

Sua raiva de Konoha iniciou quando ele ainda era habitante da Vila da Folha. Quando jovem, Orochimaru estava cotado a se tornar Hokage, o que não ocorreu, sendo preterido para dar lugar ao Quarto Hokage. O antigo Hokage, Sarutobi, explica que Orochimaru, embora tivesse alta capacidade, era uma pessoa com os ideais tortos, corrompido pela sede de poder, e por isso não foi escolhido. Ele continuou vivendo em Konoha, mas com raiva de seu tutor, Sarutobi, e de todo o vilarejo. Acreditando no ideal de que o ninja mais poderoso é aquele que sabe mais jutsus ele começa a aprender vários, mas ele percebe uma coisa: existem milhares de jutsus, e a vida humana é muito curta para todo esse aprendizado. Ele começa a pensar num jutsu da imortalidade, o Fushi Tensei, usando corpos de ninjas de Konoha como cobaias. Numa outra experiência, ele pega as células do Shodaime Hokage e injeta em crianças para conseguir obter os poderes dele, a habilidade com a madeira (Mokuton no Jutsu) e o controle dos bijuus (Hokage Shiki Jijun Jutsu • Kakuan Nitten Suishu), só que todos morrem. Mais tarde se descobre que Yamato (Naruto) é o único sobrevivente, ganhando todos esses poderes. Sarutobi, cansado das experiências de Orochimaru, parte com dois ANBUs para pegá-lo, só que Orochimaru foge. Orochimaru entra na organização conhecida como Akatsuki para conseguir um corpo poderoso para transferir sua alma, o de Uchiha Itachi, só que ele foge da organização com medo de Itachi e seu imenso poder. Quando fugiu da Akatsuki, Orochimaru levou o anel da Akatsuki consigo, começando a se esconder, prevendo um possível ataque dessa organização. Alguns anos depois dessa fuga Sasori, um ninja da Akatsuki, manda um espião para se infiltrar no grupo de Orochimaru. Usando um jutsu de esquecimento, Kenboushou Jutsu, Sasori envia Yakushi Kabuto. O que Sasori não esperava era que Orochimaru conseguisse atrair o jovem ninja médico, tirando o jutsu de Sasori, transformando-o no seu braço direito. Com a ajuda de Kabuto seu Fushi Tensei é finalizado, e Orochimaru troca de corpo. Ele funda o Vilarejo Escondido do Som, colocando vários ninjas ao seu dispor, como Kaguya Kimimaro. Usando esse Vilarejo, ele decide fazer um acordo com o vilarejo de Suna. Tomando o lugar do Kazekage, morto por suas mãos, ele autoriza uma ação contra Konoha com a ajuda do Vilarejo do Som. Som e Areia se unirão num ataque contra Konoha, e as principais armas serão Gaara, e o Ichibi dentro dele, e Kaguya Kimimaro. Kimimaro fica doente e não pode entrar. O ataque deveria acontecer durante o Chuunin Shiken no meio da terceira prova. Na segunda prova, Orochimaru pega o lugar de um participante do exame e ataca o time de Uzumaki Naruto, Haruno Sakura e Uchiha Sasuke. Ele põe um Selo Amaldiçoado no Sasuke, dizendo que se ele quiser poder para matar Uchiha Itachi, deve se juntar ao grupo dele, Orochimaru. O ataque acontece na terceira fase, só que Gaara teve que recuar, o que atrasou os planos de Orochimaru. Os ninjas do Som e da Areia foram vencidos pelos de Konoha com a ajuda de outro sannin, Jiraya. Orochimaru então duela com o Sandaime Hokage, seu tutor. Invoca, com seu Edo Tensei, o Nidaime Hokage e o Shodaime Hokage. Sarutobi se vê sem escolha, e com seu Shiki Fuujin sela os dois Hokages. Na hora de prender Orochimaru, a espada Kusanagi entra na sua barriga, tirando as forças do Sarutobi. Sem escolha, o Sandaime Hokage sela os braços de Orochimaru, proibindo-o de usar qualquer tipo de jutsu. Orochimaru percebe que só existem dois jeitos de conseguir curar seus braços: pedir para outra sannin, Tsunade, ou mudar para um novo corpo, no caso Uchiha Sasuke. Ele decide pegar Tsunade. Promete para ela que irá reviver o irmão e o amante dela se ela curar os braços dele, e ele dá uma semana para ela pensar, exigindo dois corpos como sacrifício. Só que tem um problema: Jiraya e Uzumaki Naruto aparecem, mudando a cabeça de Tsunade, que trava uma batalha com Orochimaru. Kabuto é derrotado pelo Rasengan de Naruto, e Orochimaru decide enfrentar sozinho Jiraiya (com o controle de chakra debilitado) e Tsunade, perdendo. Orochimaru, então, precisa de um corpo para hospedar sua alma amaldiçoada. Ele convence Uchiha Sasuke a se juntar a ele para conseguir poder para sua vingança contra Itachi. A chegada de Sasuke foi atrasada, e ele teve que trocar de corpo antes. O escolhido foi Gen'yumaru, usado em suas experiências junto com seu clã. Agora, ele só pode trocar de corpo 3 anos depois. Mesmo assim, Sasuke se alia com ele. Durante vários meses, Orochimaru treina Sasuke, ensinando jutsus, kinjutsus e outras técnicas. Dois anos e meio depois, Orochimaru fica sabendo da boca de Kabuto que ele iria se encontrar com Sasori numa ponte. Orochimaru propõe pegá-lo, e é para o Kabuto fingir que ainda é subordinado dele. O Sasori aparece, e Kabuto começa a agir. Orochimaru aparecece e Kabuto quebra o boneco de Sasori: sai de dentro Yamato, aparecendo mais tarde Haruno Sakura, Sai e Uzumaki Naruto. Orochimaru não se espanta pela presença dos ninjas de Konoha, só se espanta pelo fato de Yamato estar vivo, e explica para Yamato sua experiência com as células do Shodaime Hokage. Ele fala do Sasuke, deixando Naruto nervoso. Naruto libera o chakra da Kyuubi e destrói a ponte. Orochimaru pula pro outro lado da ponte e é seguido por Naruto com três caudas. Do outro lado, Naruto libera a quarta cauda e ganha uma aparência bem próxima a da raposa. Os dois lutam, mantendo um nível parecido. Depois de usar todo seu chakra, o corpo de Orochimaru começa a rejeitá-lo, e ele decide acabar com a diversão, com o consolo de ter o Sasuke. É quando aparece Sai, dizendo que Danzou tem uma mensagem para ele. Orochimaru de início quer ignorar a mensagem de Sai, mas se dispõe a ler a mensagem e impede Kabuto de tentar algo contra Sai, dizendo que ele irá para seu esconderijo. Na viagem, Orochimaru percebe que está sendo seguido. Kabuto confirma suas suspeitas. Assim, ele põe um corpo, disfarçado de Sai, pendurado numa árvore, com as habilidades de Kabuto. Orochimaru leva os dois para seu esconderijo. Lá está um ninja com um Sharingan: Uchiha Sasuke, nervoso com o atraso de Orochimaru. Orochimaru avisa Sai do perigo que é Sasuke, pedindo para Kabuto guardar o presente de Danzou: uma lista de todos os ANBUs. Andando pelo seu esconderijo, encontra Sai e Naruto conversando. Orochimaru pergunta de que lado Sai está, atacando os dois. Se surpreende ao ver que Sai o traiu. Naruto tenta segurar Orochimaru. Depois de ver que os esforços de Naruto são inúteis contra ele, Yamato e Haruno Sakura chegam. Orochimaru diz que vai deixá-los vivos se eles derrubarem mais um Akatsuki, fugindo. liberta Kabuto, que estava preso, e vai encontrar Uchiha Sasuke, que está enfrentando os ninjas de Konoha. Orochimaru o impede de continuar, e eles fogem.